Beyin MR T1 Görüntülerde Volbrain Kullanılarak Beyinle İlgili Yapıların Segmentasyonu ve ITKSnap ile Üç Boyutlu Modelleme Kursu
24.08.2025
MR T1 görüntüleme klinikte rutin olarak yapılmaktadır. Bu çekimlerin bazıları ise volumetrik olup değişik sekanslarda yapılmaktadır. Bilindiği üzere beyin içerisinde thalamus duyuların entegresyanu ilgili önemli bir yapılardan birisidir. Thalamus başta şizofreni, esansiyel tremor ve multiple sclerosis olmak üzere çok sayıda psikiyatrik ve nörolojik hastalıklarda hacimsel değişiklikler göstermektedir. Bunun dışında anatomi eğitiminde hipokampüs kısımları, serbellar lobulllerin gösterilmesi ve thalamus çekirdeklerinin anlatılması da zordur. Aynı zamanda thalamus çekirdeklerine derin beyin stimülasyonları da yapılmaktadır. Günümüzde farklı yazılımlar kullanılarak hipokampüs, serebellar çekirdekler, thalamus ve thalamus çekirdeklerinin hacimleri ölçülmektedir. Bu yazılımların bazıları otomatik bazıları ise yarı otomatiktir. Bu kursta otomatik olarak kullanılan ve bilimsel geçerliliği tüm dünyada kabul görmüş Volbrain kullanılarak beyinle ilgili yapıların parselasyon haritaları elde edilecektir. Volbrain web adresine (https://www.volbrain.net/) girilerek önce kayıt oluşturulacaktır. VolBrain, MR T1 görüntülerinin yüklendiği ve sonuçların birkaç dakika sonra elde edildiği ücretsiz bir bulut sistemidir. MR T1 datasını volbraine yüklemeden önce MR cihazından alınan DICOM görüntüler mricron ile sıkıştırılmış niftii (gz) formatına çevrilmesi ve tek bir dosya oluşturması da gerekmektedir.
Volbrain’den indirilen sonuçlar ITKSnap ile üç boyutlu görüntülenecek ve kayıt edilecektir. Aynı zamanda burdan STL formatında kayıt edilen üç boyutlu STL formatındaki dosyalar direk üç boyutlu yazıcılardan da çıktı alınabilmektedir. Kursa katılan katılımcılar volbrain sistemi ile dosyalarını yükleyecek, hacim sonuçlarını elde edecek ve ITKSnap ile de üç boyutlu görüntüleyebileceklerdir. Konu ile ilgili bu sistem kullanılarak beyinle ilgili tüm nörolojik ve psikiyatrik hastalıklarda beyinle ilgili yapıların hacimlerinin değişip değişmediğini göstermek için tez, yayın ve proje yapılabilir.
Kurs Sorumluları:
Kurs Süresi: 10:00'da başlayıp 15.00'da bitecektir.
Katılımcı Sayısı: 20 kişi
Kullanılanacak Programlar:
1. ITKSnap http://www.itksnap.org/pmwiki/pmwiki.php?n=Downloads.SNAP4
2.Mricon https://www.nitrc.org/projects/mricron/
3.mricroGL
Kurs sonunda neler öğrenilecektir?
1. Hipokampüs, serebellar lobuller ve thalamus çekirdekleri ve sağ ve sol kısımlarının hacimleri elde edilecek ve yorumlanacaktır.
2. Yapılar ITKsnap ile üç boyutlu modelleri oluşturulacaktır. Elde edilen yapılar beyin içerisine gömülecek ve üç boyutlu görsel kayıtlar yapılacaktır.
3.Üç boyutlu yazıcı için dosyaların kayıt edilmesi gösterilecektir.
Önemli not: Her katılımcı kendi laptopu ile gelmelidir. (tercihen Windows tabanlı, en az 4 GB Ram ve en az i3 işlemci, 5 GB boş disk alanı), kurs günü kurstan yarım saat önce kurs ekibi tarafından katılımcılara ITKSnap programı kurulacaktır.
Kurslara kayıt olmak için aşağıdaki butona tıklayarak kurs kayıt formunu doldurmanız gerekmektedir.
Kurslar 24 Ağustos 2025, Pazar günü gerçekleştirilecektir.
Kurslar için kayıt ücreti her bir kurs için 1.500 TL (KDV dahil) şeklindedir.
KAYIT İPTAL ŞARTLARI
Kayıt ücretleri iadesi ile ilgili olarak;
❋ 1 Ağustos 2025 tarihine kadar bildirildiği takdirde ücretlerin tamamı,
❋ 2 Ağustos - 10 Ağustos 2025 tarihleri arasında bildirildiği takdirde ücretlerin %50'si iade edilecektir.
❋ 10 Ağustos 2025 tarihinden sonra bildirilen iptaller dikkate alınmayacaktır.
❋ Tüm iadeler kongre bitiminden sonra gerçekleştirilecektir.İptal talepleri mutlaka yazılı olarak bildirilmelidir.
❋ Kayıt ilgili iptal işlemleri için kayıt sorumlusu Şura Durmuşoğlu ile suradurmusoglu@nlmice.com adresinden iletişime geçebilirsiniz.
BANKA HESAP BİLGİLERİ
HESAP ADI: NL MICE ETKİNLİK YÖNETİMİ VE TURİZM A.Ş.
BANKA: GARANTİ BANKASI ŞUBE KODU – 713
HESAP NO: 6296133
IBAN NO: TR49 0006 2000 7130 0006 2961 33
❋ Banka havalesi ile yaptığınız ödemelerin dekontlarını kayıt formunun içine yüklemeniz gerekmektedir.
❋ Dekont açıklamasına mutlaka katılımcının adı-soyadı ve UAKKURS yazılmalıdır. Açıklama bulunmayan dekontların işleme alınamamasından organizasyon sekretaryası sorumlu değildir.
❋ İptal talepleri mutlaka yazılı olarak bildirilmelidir. Kayıt ile ilgili iptal işlemleri için kayıt sorumlusu Şura Durmuşoğlu ile suradurmusoglu@nlmice.com adresinden iletişime geçebilirsiniz.
